Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE7AQ13946 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PDE7AQ13946 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE7AQ13946 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE7AQ13946 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE7AQ13946 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDE7AQ13946 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE7AQ13946 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE7AQ13946 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PDE7AQ13946 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PDE7AQ13946 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDE7AQ13946 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE7AQ13946 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE7AQ13946 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE7AQ13946 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE7AQ13946 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE7AQ13946 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE7AQ13946 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE7AQ13946 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE7AQ13946 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE7AQ13946 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE7AQ13946 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE7AQ13946 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE7AQ13946 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE7AQ13946 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE7AQ13946 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE7AQ13946 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE7AQ13946 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE7AQ13946 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE7AQ13946 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE7AQ13946 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE7AQ13946 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE7AQ13946 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE7AQ13946 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE7AQ13946 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE7AQ13946 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE7AQ13946 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE7AQ13946 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE7AQ13946 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE7AQ13946 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE7AQ13946 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE7AQ13946 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDE7AQ13946 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE7AQ13946 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE7AQ13946 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE7AQ13946 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE7AQ13946 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE7AQ13946 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE7AQ13946 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE7AQ13946 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE7AQ13946 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE7AQ13946 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE7AQ13946 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE7AQ13946 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE7AQ13946 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE7AQ13946 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE7AQ13946 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE7AQ13946 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE7AQ13946 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE7AQ13946 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE7AQ13946 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE7AQ13946 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE7AQ13946 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE7AQ13946 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE7AQ13946 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE7AQ13946 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE7AQ13946 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE7AQ13946 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE7AQ13946 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE7AQ13946 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE7AQ13946 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE7AQ13946 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE7AQ13946 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE7AQ13946 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE7AQ13946 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE7AQ13946 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE7AQ13946 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE7AQ13946 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE7AQ13946 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE7AQ13946 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE7AQ13946 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE7AQ13946 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE7AQ13946 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE7AQ13946 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE7AQ13946 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PDE7AQ13946 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE7AQ13946 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE7AQ13946 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE7AQ13946 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE7AQ13946 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE7AQ13946 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE7AQ13946 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE7AQ13946 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE7AQ13946 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE7AQ13946 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE7AQ13946 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE7AQ13946 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE7AQ13946 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE7AQ13946 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE7AQ13946 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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