Protein–RNA interactions for Protein: Q13277

STX3, Syntaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX3Q13277 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STX3Q13277 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STX3Q13277 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
STX3Q13277 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
STX3Q13277 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STX3Q13277 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
STX3Q13277 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
STX3Q13277 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
STX3Q13277 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STX3Q13277 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
STX3Q13277 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
STX3Q13277 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
STX3Q13277 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
STX3Q13277 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
STX3Q13277 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
STX3Q13277 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
STX3Q13277 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
STX3Q13277 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
STX3Q13277 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
STX3Q13277 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
STX3Q13277 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
STX3Q13277 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
STX3Q13277 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
STX3Q13277 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STX3Q13277 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STX3Q13277 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
STX3Q13277 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STX3Q13277 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STX3Q13277 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STX3Q13277 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
STX3Q13277 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STX3Q13277 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STX3Q13277 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STX3Q13277 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
STX3Q13277 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
STX3Q13277 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
STX3Q13277 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STX3Q13277 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STX3Q13277 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STX3Q13277 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX3Q13277 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STX3Q13277 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STX3Q13277 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX3Q13277 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX3Q13277 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX3Q13277 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STX3Q13277 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
STX3Q13277 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX3Q13277 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX3Q13277 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX3Q13277 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX3Q13277 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
STX3Q13277 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STX3Q13277 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STX3Q13277 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
STX3Q13277 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
STX3Q13277 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STX3Q13277 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STX3Q13277 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STX3Q13277 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
STX3Q13277 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STX3Q13277 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
STX3Q13277 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STX3Q13277 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STX3Q13277 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STX3Q13277 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX3Q13277 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX3Q13277 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STX3Q13277 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STX3Q13277 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STX3Q13277 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STX3Q13277 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STX3Q13277 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STX3Q13277 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX3Q13277 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX3Q13277 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STX3Q13277 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
STX3Q13277 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STX3Q13277 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STX3Q13277 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STX3Q13277 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STX3Q13277 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STX3Q13277 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STX3Q13277 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STX3Q13277 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STX3Q13277 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX3Q13277 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX3Q13277 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX3Q13277 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX3Q13277 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX3Q13277 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STX3Q13277 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STX3Q13277 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX3Q13277 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STX3Q13277 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STX3Q13277 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX3Q13277 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX3Q13277 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX3Q13277 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX3Q13277 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms