Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CALCOCO2Q13137 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CALCOCO2Q13137 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CALCOCO2Q13137 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CALCOCO2Q13137 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CALCOCO2Q13137 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CALCOCO2Q13137 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CALCOCO2Q13137 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CALCOCO2Q13137 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CALCOCO2Q13137 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CALCOCO2Q13137 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CALCOCO2Q13137 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CALCOCO2Q13137 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CALCOCO2Q13137 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CALCOCO2Q13137 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CALCOCO2Q13137 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CALCOCO2Q13137 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CALCOCO2Q13137 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CALCOCO2Q13137 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CALCOCO2Q13137 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CALCOCO2Q13137 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CALCOCO2Q13137 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CALCOCO2Q13137 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CALCOCO2Q13137 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CALCOCO2Q13137 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CALCOCO2Q13137 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CALCOCO2Q13137 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CALCOCO2Q13137 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CALCOCO2Q13137 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CALCOCO2Q13137 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CALCOCO2Q13137 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CALCOCO2Q13137 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALCOCO2Q13137 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CALCOCO2Q13137 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALCOCO2Q13137 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CALCOCO2Q13137 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CALCOCO2Q13137 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CALCOCO2Q13137 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CALCOCO2Q13137 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CALCOCO2Q13137 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CALCOCO2Q13137 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CALCOCO2Q13137 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALCOCO2Q13137 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CALCOCO2Q13137 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALCOCO2Q13137 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALCOCO2Q13137 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CALCOCO2Q13137 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALCOCO2Q13137 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CALCOCO2Q13137 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALCOCO2Q13137 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALCOCO2Q13137 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALCOCO2Q13137 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALCOCO2Q13137 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CALCOCO2Q13137 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CALCOCO2Q13137 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CALCOCO2Q13137 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALCOCO2Q13137 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALCOCO2Q13137 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CALCOCO2Q13137 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALCOCO2Q13137 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALCOCO2Q13137 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALCOCO2Q13137 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALCOCO2Q13137 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALCOCO2Q13137 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALCOCO2Q13137 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CALCOCO2Q13137 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CALCOCO2Q13137 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CALCOCO2Q13137 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALCOCO2Q13137 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALCOCO2Q13137 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALCOCO2Q13137 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CALCOCO2Q13137 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CALCOCO2Q13137 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CALCOCO2Q13137 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALCOCO2Q13137 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CALCOCO2Q13137 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CALCOCO2Q13137 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CALCOCO2Q13137 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO2Q13137 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO2Q13137 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALCOCO2Q13137 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALCOCO2Q13137 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALCOCO2Q13137 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CALCOCO2Q13137 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CALCOCO2Q13137 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CALCOCO2Q13137 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALCOCO2Q13137 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CALCOCO2Q13137 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
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