Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23not detected
FMR1Q06787 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23not detected
FMR1Q06787 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17not detected
FMR1Q06787 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07not detected
FMR1Q06787 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4not detected
FMR1Q06787 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97not detected
FMR1Q06787 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96not detected
FMR1Q06787 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95not detected
FMR1Q06787 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.933e-11■■■■■ 66.2
FMR1Q06787 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.934e-17■□□□□ 8.9
FMR1Q06787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.96e-11■■□□□ 12.7
FMR1Q06787 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88not detected
FMR1Q06787 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87not detected
FMR1Q06787 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86not detected
FMR1Q06787 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85not detected
FMR1Q06787 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84not detected
FMR1Q06787 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8not detected
FMR1Q06787 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78not detected
FMR1Q06787 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77not detected
FMR1Q06787 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76not detected
FMR1Q06787 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76not detected
FMR1Q06787 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75not detected
FMR1Q06787 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75not detected
FMR1Q06787 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73not detected
FMR1Q06787 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73not detected
FMR1Q06787 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72not detected
FMR1Q06787 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.725e-6■■□□□ 13
FMR1Q06787 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69not detected
FMR1Q06787 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68not detected
FMR1Q06787 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67not detected
FMR1Q06787 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67not detected
FMR1Q06787 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66not detected
FMR1Q06787 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6not detected
FMR1Q06787 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6not detected
FMR1Q06787 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6not detected
FMR1Q06787 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58not detected
FMR1Q06787 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55not detected
FMR1Q06787 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54not detected
FMR1Q06787 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54not detected
FMR1Q06787 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.533e-8■■□□□ 12
FMR1Q06787 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53not detected
FMR1Q06787 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52not detected
FMR1Q06787 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.53e-8■■□□□ 12
FMR1Q06787 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5not detected
FMR1Q06787 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5not detected
FMR1Q06787 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5not detected
FMR1Q06787 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5not detected
FMR1Q06787 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.53e-11■■■■■ 66.2
FMR1Q06787 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48not detected
FMR1Q06787 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48not detected
FMR1Q06787 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48not detected
FMR1Q06787 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47not detected
FMR1Q06787 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46not detected
FMR1Q06787 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46not detected
FMR1Q06787 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46not detected
FMR1Q06787 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45not detected
FMR1Q06787 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45not detected
FMR1Q06787 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45not detected
FMR1Q06787 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43not detected
FMR1Q06787 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43not detected
FMR1Q06787 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43not detected
FMR1Q06787 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42not detected
FMR1Q06787 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42not detected
FMR1Q06787 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42not detected
FMR1Q06787 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41not detected
FMR1Q06787 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41not detected
FMR1Q06787 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4not detected
FMR1Q06787 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4not detected
FMR1Q06787 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4not detected
FMR1Q06787 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39not detected
FMR1Q06787 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.392e-9■■□□□ 12
FMR1Q06787 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38not detected
FMR1Q06787 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38not detected
FMR1Q06787 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38not detected
FMR1Q06787 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37not detected
FMR1Q06787 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37not detected
FMR1Q06787 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37not detected
FMR1Q06787 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.362e-9■■□□□ 12
FMR1Q06787 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35not detected
FMR1Q06787 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34not detected
FMR1Q06787 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34not detected
FMR1Q06787 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34not detected
FMR1Q06787 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33not detected
FMR1Q06787 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33not detected
FMR1Q06787 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33not detected
FMR1Q06787 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32not detected
FMR1Q06787 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32not detected
FMR1Q06787 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32not detected
FMR1Q06787 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.321e-8■□□□□ 9.5
FMR1Q06787 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32not detected
FMR1Q06787 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31not detected
FMR1Q06787 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31not detected
FMR1Q06787 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31not detected
FMR1Q06787 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31not detected
FMR1Q06787 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.312e-9■■□□□ 12
FMR1Q06787 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.312e-9■■□□□ 12
FMR1Q06787 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.319e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.33e-15■■■■■ 53.5
FMR1Q06787 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3not detected
FMR1Q06787 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms