Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ACTR1AP61163 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ACTR1AP61163 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ACTR1AP61163 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ACTR1AP61163 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ACTR1AP61163 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ACTR1AP61163 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ACTR1AP61163 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ACTR1AP61163 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ACTR1AP61163 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ACTR1AP61163 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ACTR1AP61163 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ACTR1AP61163 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACTR1AP61163 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ACTR1AP61163 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ACTR1AP61163 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ACTR1AP61163 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ACTR1AP61163 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ACTR1AP61163 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ACTR1AP61163 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ACTR1AP61163 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ACTR1AP61163 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ACTR1AP61163 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ACTR1AP61163 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ACTR1AP61163 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ACTR1AP61163 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ACTR1AP61163 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ACTR1AP61163 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTR1AP61163 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTR1AP61163 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ACTR1AP61163 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ACTR1AP61163 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ACTR1AP61163 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ACTR1AP61163 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ACTR1AP61163 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACTR1AP61163 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTR1AP61163 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ACTR1AP61163 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTR1AP61163 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ACTR1AP61163 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ACTR1AP61163 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ACTR1AP61163 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ACTR1AP61163 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACTR1AP61163 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ACTR1AP61163 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACTR1AP61163 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACTR1AP61163 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ACTR1AP61163 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ACTR1AP61163 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACTR1AP61163 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTR1AP61163 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTR1AP61163 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ACTR1AP61163 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ACTR1AP61163 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR1AP61163 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ACTR1AP61163 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ACTR1AP61163 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACTR1AP61163 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ACTR1AP61163 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACTR1AP61163 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACTR1AP61163 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACTR1AP61163 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACTR1AP61163 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTR1AP61163 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTR1AP61163 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTR1AP61163 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTR1AP61163 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTR1AP61163 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTR1AP61163 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTR1AP61163 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTR1AP61163 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTR1AP61163 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTR1AP61163 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTR1AP61163 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACTR1AP61163 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTR1AP61163 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTR1AP61163 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTR1AP61163 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACTR1AP61163 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTR1AP61163 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTR1AP61163 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACTR1AP61163 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTR1AP61163 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTR1AP61163 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTR1AP61163 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTR1AP61163 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTR1AP61163 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTR1AP61163 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTR1AP61163 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTR1AP61163 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTR1AP61163 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTR1AP61163 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTR1AP61163 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms