Protein–RNA interactions for Protein: P61160

ACTR2, Actin-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR2P61160 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ACTR2P61160 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ACTR2P61160 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ACTR2P61160 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ACTR2P61160 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ACTR2P61160 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ACTR2P61160 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
ACTR2P61160 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ACTR2P61160 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ACTR2P61160 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ACTR2P61160 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACTR2P61160 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ACTR2P61160 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ACTR2P61160 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ACTR2P61160 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ACTR2P61160 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ACTR2P61160 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ACTR2P61160 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ACTR2P61160 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ACTR2P61160 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ACTR2P61160 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ACTR2P61160 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ACTR2P61160 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ACTR2P61160 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACTR2P61160 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ACTR2P61160 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ACTR2P61160 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ACTR2P61160 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ACTR2P61160 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ACTR2P61160 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ACTR2P61160 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ACTR2P61160 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ACTR2P61160 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ACTR2P61160 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ACTR2P61160 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ACTR2P61160 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ACTR2P61160 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ACTR2P61160 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ACTR2P61160 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ACTR2P61160 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ACTR2P61160 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ACTR2P61160 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ACTR2P61160 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ACTR2P61160 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ACTR2P61160 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ACTR2P61160 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACTR2P61160 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ACTR2P61160 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ACTR2P61160 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACTR2P61160 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACTR2P61160 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ACTR2P61160 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ACTR2P61160 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ACTR2P61160 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ACTR2P61160 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ACTR2P61160 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ACTR2P61160 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ACTR2P61160 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ACTR2P61160 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ACTR2P61160 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ACTR2P61160 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ACTR2P61160 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ACTR2P61160 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ACTR2P61160 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ACTR2P61160 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ACTR2P61160 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ACTR2P61160 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ACTR2P61160 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ACTR2P61160 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ACTR2P61160 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACTR2P61160 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACTR2P61160 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACTR2P61160 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ACTR2P61160 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ACTR2P61160 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ACTR2P61160 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ACTR2P61160 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ACTR2P61160 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ACTR2P61160 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ACTR2P61160 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ACTR2P61160 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ACTR2P61160 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ACTR2P61160 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ACTR2P61160 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ACTR2P61160 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ACTR2P61160 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ACTR2P61160 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ACTR2P61160 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms