Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RWDD2BP57060 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
RWDD2BP57060 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RWDD2BP57060 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
RWDD2BP57060 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RWDD2BP57060 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
RWDD2BP57060 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RWDD2BP57060 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RWDD2BP57060 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RWDD2BP57060 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RWDD2BP57060 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RWDD2BP57060 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RWDD2BP57060 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RWDD2BP57060 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RWDD2BP57060 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RWDD2BP57060 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD2BP57060 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RWDD2BP57060 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RWDD2BP57060 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RWDD2BP57060 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RWDD2BP57060 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RWDD2BP57060 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RWDD2BP57060 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RWDD2BP57060 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RWDD2BP57060 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RWDD2BP57060 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RWDD2BP57060 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RWDD2BP57060 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RWDD2BP57060 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RWDD2BP57060 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RWDD2BP57060 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RWDD2BP57060 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RWDD2BP57060 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RWDD2BP57060 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
RWDD2BP57060 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RWDD2BP57060 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RWDD2BP57060 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RWDD2BP57060 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RWDD2BP57060 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
RWDD2BP57060 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RWDD2BP57060 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
RWDD2BP57060 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RWDD2BP57060 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RWDD2BP57060 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RWDD2BP57060 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RWDD2BP57060 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RWDD2BP57060 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RWDD2BP57060 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RWDD2BP57060 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RWDD2BP57060 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RWDD2BP57060 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RWDD2BP57060 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RWDD2BP57060 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RWDD2BP57060 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RWDD2BP57060 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RWDD2BP57060 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RWDD2BP57060 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RWDD2BP57060 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RWDD2BP57060 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RWDD2BP57060 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RWDD2BP57060 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RWDD2BP57060 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RWDD2BP57060 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RWDD2BP57060 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RWDD2BP57060 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RWDD2BP57060 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RWDD2BP57060 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RWDD2BP57060 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RWDD2BP57060 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RWDD2BP57060 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RWDD2BP57060 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RWDD2BP57060 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RWDD2BP57060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RWDD2BP57060 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RWDD2BP57060 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RWDD2BP57060 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RWDD2BP57060 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RWDD2BP57060 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RWDD2BP57060 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RWDD2BP57060 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RWDD2BP57060 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RWDD2BP57060 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RWDD2BP57060 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RWDD2BP57060 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RWDD2BP57060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RWDD2BP57060 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RWDD2BP57060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RWDD2BP57060 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RWDD2BP57060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RWDD2BP57060 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD2BP57060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RWDD2BP57060 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD2BP57060 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD2BP57060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD2BP57060 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms