Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CRATP43155 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CRATP43155 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CRATP43155 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CRATP43155 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CRATP43155 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRATP43155 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRATP43155 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CRATP43155 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CRATP43155 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CRATP43155 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRATP43155 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRATP43155 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRATP43155 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRATP43155 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRATP43155 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CRATP43155 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRATP43155 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CRATP43155 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRATP43155 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRATP43155 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRATP43155 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRATP43155 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRATP43155 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRATP43155 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRATP43155 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CRATP43155 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CRATP43155 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRATP43155 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRATP43155 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRATP43155 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRATP43155 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRATP43155 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRATP43155 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRATP43155 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRATP43155 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRATP43155 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRATP43155 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRATP43155 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CRATP43155 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CRATP43155 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CRATP43155 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRATP43155 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRATP43155 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRATP43155 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRATP43155 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRATP43155 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CRATP43155 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CRATP43155 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRATP43155 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRATP43155 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CRATP43155 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRATP43155 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CRATP43155 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRATP43155 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRATP43155 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRATP43155 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRATP43155 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRATP43155 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRATP43155 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRATP43155 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRATP43155 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRATP43155 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRATP43155 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRATP43155 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRATP43155 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRATP43155 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRATP43155 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRATP43155 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRATP43155 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRATP43155 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRATP43155 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRATP43155 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRATP43155 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRATP43155 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRATP43155 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRATP43155 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRATP43155 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRATP43155 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRATP43155 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRATP43155 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRATP43155 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRATP43155 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRATP43155 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRATP43155 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRATP43155 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRATP43155 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRATP43155 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRATP43155 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRATP43155 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRATP43155 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRATP43155 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRATP43155 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRATP43155 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRATP43155 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRATP43155 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRATP43155 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRATP43155 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRATP43155 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRATP43155 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms