Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BRS3P32247 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRS3P32247 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRS3P32247 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRS3P32247 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRS3P32247 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRS3P32247 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRS3P32247 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRS3P32247 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRS3P32247 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRS3P32247 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRS3P32247 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRS3P32247 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRS3P32247 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRS3P32247 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRS3P32247 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRS3P32247 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRS3P32247 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRS3P32247 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRS3P32247 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRS3P32247 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRS3P32247 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRS3P32247 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRS3P32247 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRS3P32247 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRS3P32247 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRS3P32247 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRS3P32247 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRS3P32247 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRS3P32247 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRS3P32247 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRS3P32247 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRS3P32247 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRS3P32247 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRS3P32247 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRS3P32247 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRS3P32247 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRS3P32247 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRS3P32247 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRS3P32247 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRS3P32247 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRS3P32247 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRS3P32247 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRS3P32247 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRS3P32247 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRS3P32247 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRS3P32247 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRS3P32247 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRS3P32247 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRS3P32247 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRS3P32247 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRS3P32247 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRS3P32247 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRS3P32247 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRS3P32247 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRS3P32247 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRS3P32247 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRS3P32247 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRS3P32247 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRS3P32247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRS3P32247 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRS3P32247 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRS3P32247 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRS3P32247 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRS3P32247 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRS3P32247 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRS3P32247 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRS3P32247 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRS3P32247 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRS3P32247 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRS3P32247 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRS3P32247 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRS3P32247 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRS3P32247 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRS3P32247 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRS3P32247 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRS3P32247 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRS3P32247 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRS3P32247 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRS3P32247 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRS3P32247 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRS3P32247 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRS3P32247 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRS3P32247 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRS3P32247 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRS3P32247 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRS3P32247 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRS3P32247 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRS3P32247 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRS3P32247 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRS3P32247 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRS3P32247 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRS3P32247 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRS3P32247 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRS3P32247 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRS3P32247 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRS3P32247 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRS3P32247 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRS3P32247 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRS3P32247 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms