Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAPN3P20807 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
CAPN3P20807 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CAPN3P20807 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CAPN3P20807 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAPN3P20807 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CAPN3P20807 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAPN3P20807 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAPN3P20807 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAPN3P20807 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPN3P20807 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPN3P20807 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPN3P20807 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPN3P20807 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAPN3P20807 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAPN3P20807 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAPN3P20807 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPN3P20807 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CAPN3P20807 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAPN3P20807 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAPN3P20807 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAPN3P20807 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAPN3P20807 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPN3P20807 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPN3P20807 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAPN3P20807 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPN3P20807 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN3P20807 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN3P20807 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN3P20807 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAPN3P20807 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN3P20807 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN3P20807 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN3P20807 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN3P20807 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN3P20807 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN3P20807 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN3P20807 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN3P20807 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN3P20807 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN3P20807 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN3P20807 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN3P20807 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN3P20807 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN3P20807 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN3P20807 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN3P20807 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN3P20807 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAPN3P20807 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN3P20807 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN3P20807 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN3P20807 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN3P20807 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN3P20807 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAPN3P20807 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN3P20807 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN3P20807 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPN3P20807 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN3P20807 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN3P20807 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN3P20807 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN3P20807 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN3P20807 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN3P20807 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN3P20807 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN3P20807 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN3P20807 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPN3P20807 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN3P20807 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN3P20807 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN3P20807 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN3P20807 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN3P20807 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN3P20807 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN3P20807 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN3P20807 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN3P20807 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN3P20807 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN3P20807 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN3P20807 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN3P20807 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN3P20807 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN3P20807 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN3P20807 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN3P20807 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN3P20807 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN3P20807 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN3P20807 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN3P20807 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms