Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TSPAN8P19075 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TSPAN8P19075 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSPAN8P19075 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TSPAN8P19075 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TSPAN8P19075 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TSPAN8P19075 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TSPAN8P19075 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TSPAN8P19075 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TSPAN8P19075 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TSPAN8P19075 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TSPAN8P19075 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSPAN8P19075 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSPAN8P19075 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSPAN8P19075 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSPAN8P19075 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSPAN8P19075 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSPAN8P19075 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TSPAN8P19075 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TSPAN8P19075 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TSPAN8P19075 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TSPAN8P19075 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TSPAN8P19075 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TSPAN8P19075 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSPAN8P19075 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TSPAN8P19075 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TSPAN8P19075 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TSPAN8P19075 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSPAN8P19075 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSPAN8P19075 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSPAN8P19075 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSPAN8P19075 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSPAN8P19075 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSPAN8P19075 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSPAN8P19075 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSPAN8P19075 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSPAN8P19075 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSPAN8P19075 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSPAN8P19075 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSPAN8P19075 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSPAN8P19075 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSPAN8P19075 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSPAN8P19075 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSPAN8P19075 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSPAN8P19075 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSPAN8P19075 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSPAN8P19075 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSPAN8P19075 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSPAN8P19075 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSPAN8P19075 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSPAN8P19075 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSPAN8P19075 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSPAN8P19075 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSPAN8P19075 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TSPAN8P19075 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TSPAN8P19075 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSPAN8P19075 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSPAN8P19075 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSPAN8P19075 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSPAN8P19075 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSPAN8P19075 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSPAN8P19075 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN8P19075 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSPAN8P19075 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSPAN8P19075 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSPAN8P19075 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN8P19075 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN8P19075 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN8P19075 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSPAN8P19075 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSPAN8P19075 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSPAN8P19075 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSPAN8P19075 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSPAN8P19075 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSPAN8P19075 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSPAN8P19075 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSPAN8P19075 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN8P19075 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN8P19075 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSPAN8P19075 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSPAN8P19075 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSPAN8P19075 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSPAN8P19075 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSPAN8P19075 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN8P19075 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSPAN8P19075 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSPAN8P19075 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSPAN8P19075 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSPAN8P19075 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSPAN8P19075 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TSPAN8P19075 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSPAN8P19075 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSPAN8P19075 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSPAN8P19075 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSPAN8P19075 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms