Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STMN1P16949 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
STMN1P16949 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STMN1P16949 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
STMN1P16949 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
STMN1P16949 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
STMN1P16949 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
STMN1P16949 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
STMN1P16949 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
STMN1P16949 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
STMN1P16949 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
STMN1P16949 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
STMN1P16949 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
STMN1P16949 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
STMN1P16949 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
STMN1P16949 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
STMN1P16949 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
STMN1P16949 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
STMN1P16949 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
STMN1P16949 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
STMN1P16949 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
STMN1P16949 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
STMN1P16949 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STMN1P16949 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STMN1P16949 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
STMN1P16949 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
STMN1P16949 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
STMN1P16949 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
STMN1P16949 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
STMN1P16949 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
STMN1P16949 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
STMN1P16949 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
STMN1P16949 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STMN1P16949 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STMN1P16949 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STMN1P16949 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STMN1P16949 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STMN1P16949 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
STMN1P16949 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
STMN1P16949 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
STMN1P16949 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
STMN1P16949 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
STMN1P16949 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STMN1P16949 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STMN1P16949 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STMN1P16949 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STMN1P16949 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STMN1P16949 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STMN1P16949 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
STMN1P16949 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STMN1P16949 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STMN1P16949 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STMN1P16949 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STMN1P16949 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STMN1P16949 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STMN1P16949 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STMN1P16949 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STMN1P16949 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STMN1P16949 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
STMN1P16949 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
STMN1P16949 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
STMN1P16949 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STMN1P16949 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STMN1P16949 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STMN1P16949 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STMN1P16949 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STMN1P16949 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STMN1P16949 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STMN1P16949 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STMN1P16949 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STMN1P16949 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STMN1P16949 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STMN1P16949 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STMN1P16949 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STMN1P16949 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STMN1P16949 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STMN1P16949 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STMN1P16949 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STMN1P16949 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STMN1P16949 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STMN1P16949 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STMN1P16949 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STMN1P16949 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STMN1P16949 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STMN1P16949 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STMN1P16949 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STMN1P16949 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STMN1P16949 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
STMN1P16949 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STMN1P16949 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STMN1P16949 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STMN1P16949 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STMN1P16949 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STMN1P16949 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STMN1P16949 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STMN1P16949 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STMN1P16949 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STMN1P16949 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STMN1P16949 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STMN1P16949 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms