Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MTHFD2P13995 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MTHFD2P13995 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
MTHFD2P13995 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MTHFD2P13995 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MTHFD2P13995 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MTHFD2P13995 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MTHFD2P13995 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MTHFD2P13995 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MTHFD2P13995 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MTHFD2P13995 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTHFD2P13995 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MTHFD2P13995 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTHFD2P13995 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTHFD2P13995 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MTHFD2P13995 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTHFD2P13995 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MTHFD2P13995 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MTHFD2P13995 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MTHFD2P13995 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MTHFD2P13995 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MTHFD2P13995 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MTHFD2P13995 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MTHFD2P13995 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MTHFD2P13995 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MTHFD2P13995 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTHFD2P13995 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MTHFD2P13995 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MTHFD2P13995 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MTHFD2P13995 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MTHFD2P13995 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MTHFD2P13995 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MTHFD2P13995 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTHFD2P13995 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTHFD2P13995 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MTHFD2P13995 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTHFD2P13995 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MTHFD2P13995 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTHFD2P13995 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTHFD2P13995 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTHFD2P13995 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTHFD2P13995 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTHFD2P13995 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTHFD2P13995 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTHFD2P13995 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTHFD2P13995 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTHFD2P13995 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTHFD2P13995 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTHFD2P13995 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTHFD2P13995 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTHFD2P13995 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MTHFD2P13995 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTHFD2P13995 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTHFD2P13995 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTHFD2P13995 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTHFD2P13995 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTHFD2P13995 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTHFD2P13995 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTHFD2P13995 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTHFD2P13995 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFD2P13995 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTHFD2P13995 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTHFD2P13995 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTHFD2P13995 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTHFD2P13995 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTHFD2P13995 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTHFD2P13995 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTHFD2P13995 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTHFD2P13995 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTHFD2P13995 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTHFD2P13995 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTHFD2P13995 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTHFD2P13995 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTHFD2P13995 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTHFD2P13995 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTHFD2P13995 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTHFD2P13995 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTHFD2P13995 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTHFD2P13995 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTHFD2P13995 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTHFD2P13995 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTHFD2P13995 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MTHFD2P13995 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD2P13995 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTHFD2P13995 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTHFD2P13995 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MTHFD2P13995 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTHFD2P13995 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTHFD2P13995 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTHFD2P13995 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFD2P13995 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFD2P13995 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFD2P13995 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFD2P13995 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTHFD2P13995 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFD2P13995 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTHFD2P13995 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTHFD2P13995 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFD2P13995 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTHFD2P13995 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms