Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SLC5A1P13866 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SLC5A1P13866 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SLC5A1P13866 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SLC5A1P13866 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
SLC5A1P13866 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
SLC5A1P13866 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
SLC5A1P13866 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SLC5A1P13866 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SLC5A1P13866 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SLC5A1P13866 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SLC5A1P13866 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SLC5A1P13866 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SLC5A1P13866 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SLC5A1P13866 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SLC5A1P13866 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SLC5A1P13866 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SLC5A1P13866 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SLC5A1P13866 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SLC5A1P13866 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SLC5A1P13866 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SLC5A1P13866 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SLC5A1P13866 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SLC5A1P13866 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SLC5A1P13866 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SLC5A1P13866 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SLC5A1P13866 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SLC5A1P13866 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SLC5A1P13866 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SLC5A1P13866 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SLC5A1P13866 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SLC5A1P13866 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SLC5A1P13866 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SLC5A1P13866 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SLC5A1P13866 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SLC5A1P13866 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SLC5A1P13866 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SLC5A1P13866 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SLC5A1P13866 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC5A1P13866 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SLC5A1P13866 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SLC5A1P13866 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SLC5A1P13866 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SLC5A1P13866 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SLC5A1P13866 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SLC5A1P13866 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC5A1P13866 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC5A1P13866 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC5A1P13866 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SLC5A1P13866 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC5A1P13866 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC5A1P13866 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC5A1P13866 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SLC5A1P13866 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SLC5A1P13866 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SLC5A1P13866 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC5A1P13866 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SLC5A1P13866 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SLC5A1P13866 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLC5A1P13866 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLC5A1P13866 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLC5A1P13866 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLC5A1P13866 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLC5A1P13866 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SLC5A1P13866 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SLC5A1P13866 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLC5A1P13866 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SLC5A1P13866 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SLC5A1P13866 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SLC5A1P13866 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SLC5A1P13866 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SLC5A1P13866 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SLC5A1P13866 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SLC5A1P13866 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SLC5A1P13866 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC5A1P13866 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC5A1P13866 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SLC5A1P13866 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SLC5A1P13866 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC5A1P13866 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC5A1P13866 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SLC5A1P13866 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SLC5A1P13866 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SLC5A1P13866 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SLC5A1P13866 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SLC5A1P13866 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SLC5A1P13866 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SLC5A1P13866 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SLC5A1P13866 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SLC5A1P13866 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SLC5A1P13866 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SLC5A1P13866 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SLC5A1P13866 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SLC5A1P13866 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms