Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
THY1P04216 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
THY1P04216 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
THY1P04216 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
THY1P04216 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
THY1P04216 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
THY1P04216 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
THY1P04216 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THY1P04216 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THY1P04216 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
THY1P04216 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
THY1P04216 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
THY1P04216 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THY1P04216 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THY1P04216 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
THY1P04216 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THY1P04216 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
THY1P04216 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
THY1P04216 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
THY1P04216 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
THY1P04216 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
THY1P04216 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THY1P04216 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
THY1P04216 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
THY1P04216 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
THY1P04216 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
THY1P04216 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
THY1P04216 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THY1P04216 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
THY1P04216 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THY1P04216 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
THY1P04216 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
THY1P04216 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THY1P04216 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THY1P04216 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THY1P04216 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THY1P04216 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
THY1P04216 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THY1P04216 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
THY1P04216 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THY1P04216 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THY1P04216 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THY1P04216 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THY1P04216 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
THY1P04216 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
THY1P04216 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THY1P04216 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
THY1P04216 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THY1P04216 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THY1P04216 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THY1P04216 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THY1P04216 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THY1P04216 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THY1P04216 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THY1P04216 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THY1P04216 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THY1P04216 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THY1P04216 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THY1P04216 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THY1P04216 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THY1P04216 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THY1P04216 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THY1P04216 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THY1P04216 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THY1P04216 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THY1P04216 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
THY1P04216 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THY1P04216 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THY1P04216 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THY1P04216 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THY1P04216 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THY1P04216 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THY1P04216 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THY1P04216 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THY1P04216 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THY1P04216 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THY1P04216 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
THY1P04216 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
THY1P04216 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THY1P04216 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THY1P04216 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THY1P04216 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THY1P04216 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THY1P04216 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THY1P04216 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THY1P04216 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THY1P04216 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
THY1P04216 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THY1P04216 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THY1P04216 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THY1P04216 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THY1P04216 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THY1P04216 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THY1P04216 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THY1P04216 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THY1P04216 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THY1P04216 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THY1P04216 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THY1P04216 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THY1P04216 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms