Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SERPINA1P01009 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SERPINA1P01009 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SERPINA1P01009 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SERPINA1P01009 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SERPINA1P01009 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SERPINA1P01009 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SERPINA1P01009 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SERPINA1P01009 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SERPINA1P01009 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SERPINA1P01009 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SERPINA1P01009 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SERPINA1P01009 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SERPINA1P01009 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SERPINA1P01009 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SERPINA1P01009 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SERPINA1P01009 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SERPINA1P01009 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SERPINA1P01009 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SERPINA1P01009 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SERPINA1P01009 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SERPINA1P01009 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SERPINA1P01009 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SERPINA1P01009 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SERPINA1P01009 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SERPINA1P01009 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SERPINA1P01009 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SERPINA1P01009 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SERPINA1P01009 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SERPINA1P01009 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SERPINA1P01009 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SERPINA1P01009 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SERPINA1P01009 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SERPINA1P01009 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SERPINA1P01009 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SERPINA1P01009 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SERPINA1P01009 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SERPINA1P01009 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SERPINA1P01009 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERPINA1P01009 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERPINA1P01009 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SERPINA1P01009 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SERPINA1P01009 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SERPINA1P01009 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERPINA1P01009 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SERPINA1P01009 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SERPINA1P01009 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERPINA1P01009 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERPINA1P01009 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINA1P01009 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERPINA1P01009 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERPINA1P01009 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERPINA1P01009 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERPINA1P01009 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERPINA1P01009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERPINA1P01009 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SERPINA1P01009 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINA1P01009 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINA1P01009 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINA1P01009 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINA1P01009 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERPINA1P01009 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SERPINA1P01009 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SERPINA1P01009 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SERPINA1P01009 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERPINA1P01009 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SERPINA1P01009 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERPINA1P01009 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SERPINA1P01009 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SERPINA1P01009 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERPINA1P01009 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERPINA1P01009 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERPINA1P01009 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SERPINA1P01009 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SERPINA1P01009 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SERPINA1P01009 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SERPINA1P01009 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SERPINA1P01009 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SERPINA1P01009 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SERPINA1P01009 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SERPINA1P01009 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINA1P01009 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINA1P01009 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINA1P01009 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SERPINA1P01009 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SERPINA1P01009 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SERPINA1P01009 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINA1P01009 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINA1P01009 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SERPINA1P01009 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SERPINA1P01009 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SERPINA1P01009 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SERPINA1P01009 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms