Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CH25HO95992 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CH25HO95992 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CH25HO95992 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CH25HO95992 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CH25HO95992 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CH25HO95992 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CH25HO95992 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CH25HO95992 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CH25HO95992 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CH25HO95992 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CH25HO95992 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CH25HO95992 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CH25HO95992 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CH25HO95992 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CH25HO95992 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CH25HO95992 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CH25HO95992 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CH25HO95992 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CH25HO95992 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CH25HO95992 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CH25HO95992 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CH25HO95992 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CH25HO95992 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CH25HO95992 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CH25HO95992 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CH25HO95992 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CH25HO95992 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CH25HO95992 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CH25HO95992 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CH25HO95992 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CH25HO95992 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CH25HO95992 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CH25HO95992 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CH25HO95992 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CH25HO95992 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CH25HO95992 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CH25HO95992 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CH25HO95992 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CH25HO95992 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CH25HO95992 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CH25HO95992 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CH25HO95992 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CH25HO95992 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CH25HO95992 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CH25HO95992 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CH25HO95992 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CH25HO95992 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CH25HO95992 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CH25HO95992 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CH25HO95992 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CH25HO95992 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CH25HO95992 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CH25HO95992 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CH25HO95992 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CH25HO95992 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CH25HO95992 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CH25HO95992 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CH25HO95992 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CH25HO95992 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CH25HO95992 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CH25HO95992 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CH25HO95992 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CH25HO95992 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CH25HO95992 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CH25HO95992 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CH25HO95992 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CH25HO95992 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CH25HO95992 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CH25HO95992 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CH25HO95992 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CH25HO95992 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CH25HO95992 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CH25HO95992 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CH25HO95992 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CH25HO95992 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CH25HO95992 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CH25HO95992 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CH25HO95992 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CH25HO95992 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CH25HO95992 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CH25HO95992 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CH25HO95992 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CH25HO95992 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CH25HO95992 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CH25HO95992 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CH25HO95992 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CH25HO95992 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CH25HO95992 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CH25HO95992 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CH25HO95992 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CH25HO95992 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CH25HO95992 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CH25HO95992 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CH25HO95992 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CH25HO95992 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CH25HO95992 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CH25HO95992 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CH25HO95992 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CH25HO95992 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms