Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
ATG7O95352 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATG7O95352 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATG7O95352 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ATG7O95352 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ATG7O95352 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATG7O95352 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ATG7O95352 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATG7O95352 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATG7O95352 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ATG7O95352 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
ATG7O95352 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATG7O95352 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATG7O95352 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATG7O95352 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ATG7O95352 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATG7O95352 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATG7O95352 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ATG7O95352 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATG7O95352 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATG7O95352 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATG7O95352 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATG7O95352 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATG7O95352 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATG7O95352 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATG7O95352 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATG7O95352 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATG7O95352 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATG7O95352 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATG7O95352 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATG7O95352 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATG7O95352 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATG7O95352 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ATG7O95352 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATG7O95352 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ATG7O95352 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATG7O95352 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATG7O95352 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ATG7O95352 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATG7O95352 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATG7O95352 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATG7O95352 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATG7O95352 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATG7O95352 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATG7O95352 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ATG7O95352 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ATG7O95352 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATG7O95352 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ATG7O95352 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ATG7O95352 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATG7O95352 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG7O95352 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATG7O95352 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ATG7O95352 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATG7O95352 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATG7O95352 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ATG7O95352 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ATG7O95352 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATG7O95352 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATG7O95352 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATG7O95352 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATG7O95352 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATG7O95352 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATG7O95352 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATG7O95352 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATG7O95352 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATG7O95352 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATG7O95352 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATG7O95352 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATG7O95352 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG7O95352 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG7O95352 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG7O95352 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG7O95352 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG7O95352 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ATG7O95352 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG7O95352 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG7O95352 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG7O95352 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG7O95352 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG7O95352 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG7O95352 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG7O95352 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG7O95352 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG7O95352 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG7O95352 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATG7O95352 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG7O95352 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATG7O95352 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG7O95352 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG7O95352 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG7O95352 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATG7O95352 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG7O95352 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG7O95352 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG7O95352 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG7O95352 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG7O95352 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG7O95352 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ATG7O95352 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms