Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.39
PDE8BO95263 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PDE8BO95263 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDE8BO95263 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PDE8BO95263 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PDE8BO95263 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PDE8BO95263 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PDE8BO95263 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDE8BO95263 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PDE8BO95263 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
PDE8BO95263 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDE8BO95263 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDE8BO95263 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PDE8BO95263 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PDE8BO95263 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PDE8BO95263 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDE8BO95263 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
PDE8BO95263 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PDE8BO95263 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PDE8BO95263 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDE8BO95263 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDE8BO95263 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDE8BO95263 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PDE8BO95263 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDE8BO95263 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PDE8BO95263 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PDE8BO95263 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDE8BO95263 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PDE8BO95263 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PDE8BO95263 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PDE8BO95263 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PDE8BO95263 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDE8BO95263 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDE8BO95263 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDE8BO95263 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PDE8BO95263 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDE8BO95263 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDE8BO95263 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PDE8BO95263 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDE8BO95263 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDE8BO95263 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PDE8BO95263 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PDE8BO95263 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDE8BO95263 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDE8BO95263 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDE8BO95263 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PDE8BO95263 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PDE8BO95263 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PDE8BO95263 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
PDE8BO95263 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PDE8BO95263 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDE8BO95263 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDE8BO95263 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDE8BO95263 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDE8BO95263 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PDE8BO95263 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PDE8BO95263 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PDE8BO95263 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PDE8BO95263 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PDE8BO95263 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PDE8BO95263 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PDE8BO95263 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDE8BO95263 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDE8BO95263 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDE8BO95263 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PDE8BO95263 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDE8BO95263 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDE8BO95263 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDE8BO95263 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PDE8BO95263 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PDE8BO95263 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PDE8BO95263 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PDE8BO95263 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PDE8BO95263 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDE8BO95263 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PDE8BO95263 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDE8BO95263 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDE8BO95263 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PDE8BO95263 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PDE8BO95263 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PDE8BO95263 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDE8BO95263 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDE8BO95263 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDE8BO95263 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDE8BO95263 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PDE8BO95263 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDE8BO95263 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDE8BO95263 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PDE8BO95263 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PDE8BO95263 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms