Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ULK1O75385 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ULK1O75385 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ULK1O75385 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ULK1O75385 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ULK1O75385 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ULK1O75385 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ULK1O75385 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ULK1O75385 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ULK1O75385 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ULK1O75385 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ULK1O75385 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ULK1O75385 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ULK1O75385 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ULK1O75385 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ULK1O75385 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ULK1O75385 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ULK1O75385 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ULK1O75385 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ULK1O75385 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ULK1O75385 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ULK1O75385 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ULK1O75385 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ULK1O75385 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ULK1O75385 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ULK1O75385 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ULK1O75385 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ULK1O75385 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ULK1O75385 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ULK1O75385 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ULK1O75385 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ULK1O75385 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ULK1O75385 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ULK1O75385 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ULK1O75385 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ULK1O75385 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ULK1O75385 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ULK1O75385 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ULK1O75385 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ULK1O75385 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ULK1O75385 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ULK1O75385 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ULK1O75385 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ULK1O75385 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ULK1O75385 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ULK1O75385 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ULK1O75385 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ULK1O75385 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ULK1O75385 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ULK1O75385 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ULK1O75385 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ULK1O75385 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ULK1O75385 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ULK1O75385 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ULK1O75385 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ULK1O75385 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ULK1O75385 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ULK1O75385 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ULK1O75385 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ULK1O75385 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ULK1O75385 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ULK1O75385 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ULK1O75385 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ULK1O75385 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ULK1O75385 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ULK1O75385 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ULK1O75385 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ULK1O75385 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ULK1O75385 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ULK1O75385 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ULK1O75385 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ULK1O75385 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ULK1O75385 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ULK1O75385 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ULK1O75385 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ULK1O75385 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ULK1O75385 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ULK1O75385 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ULK1O75385 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ULK1O75385 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ULK1O75385 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ULK1O75385 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ULK1O75385 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ULK1O75385 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
ULK1O75385 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ULK1O75385 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ULK1O75385 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ULK1O75385 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ULK1O75385 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ULK1O75385 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ULK1O75385 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ULK1O75385 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ULK1O75385 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ULK1O75385 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ULK1O75385 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ULK1O75385 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ULK1O75385 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ULK1O75385 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ULK1O75385 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ULK1O75385 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms