Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.49■■■■■ 6.15
FANCAO15360 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.43■■■■■ 6.14
FANCAO15360 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.72■■■■■ 6.03
FANCAO15360 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
FANCAO15360 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
FANCAO15360 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.27■■■■■ 5.8
FANCAO15360 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
FANCAO15360 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
FANCAO15360 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
FANCAO15360 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
FANCAO15360 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.76■■■■■ 5.72
FANCAO15360 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
FANCAO15360 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.63■■■■■ 5.7
FANCAO15360 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
FANCAO15360 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
FANCAO15360 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
FANCAO15360 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
FANCAO15360 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
FANCAO15360 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
FANCAO15360 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
FANCAO15360 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
FANCAO15360 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
FANCAO15360 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
FANCAO15360 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
FANCAO15360 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
FANCAO15360 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
FANCAO15360 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
FANCAO15360 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49■■■■■ 5.44
FANCAO15360 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.77■■■■■ 5.4
FANCAO15360 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
FANCAO15360 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
FANCAO15360 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
FANCAO15360 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
FANCAO15360 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.33■■■■■ 5.33
FANCAO15360 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
FANCAO15360 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
FANCAO15360 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
FANCAO15360 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
FANCAO15360 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
FANCAO15360 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
FANCAO15360 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.61■■■■■ 5.21
FANCAO15360 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
FANCAO15360 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
FANCAO15360 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
FANCAO15360 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
FANCAO15360 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
FANCAO15360 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
FANCAO15360 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
FANCAO15360 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
FANCAO15360 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
FANCAO15360 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
FANCAO15360 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
FANCAO15360 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
FANCAO15360 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
FANCAO15360 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
FANCAO15360 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
FANCAO15360 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
FANCAO15360 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
FANCAO15360 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
FANCAO15360 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
FANCAO15360 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
FANCAO15360 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
FANCAO15360 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
FANCAO15360 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
FANCAO15360 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
FANCAO15360 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
FANCAO15360 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
FANCAO15360 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
FANCAO15360 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
FANCAO15360 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
FANCAO15360 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
FANCAO15360 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
FANCAO15360 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.34■■■■■ 5.01
FANCAO15360 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
FANCAO15360 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
FANCAO15360 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
FANCAO15360 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
FANCAO15360 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.26■■■■■ 5
FANCAO15360 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
FANCAO15360 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
FANCAO15360 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
FANCAO15360 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
FANCAO15360 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
FANCAO15360 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
FANCAO15360 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
FANCAO15360 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.01■■■■■ 4.96
FANCAO15360 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
FANCAO15360 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
FANCAO15360 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
FANCAO15360 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
FANCAO15360 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
FANCAO15360 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
FANCAO15360 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
FANCAO15360 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
FANCAO15360 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
FANCAO15360 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
FANCAO15360 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.8■■■■■ 4.92
FANCAO15360 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
FANCAO15360 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
FANCAO15360 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms