Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRTAP4-16G5E9R7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRTAP4-16G5E9R7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP4-16G5E9R7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP4-16G5E9R7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP4-16G5E9R7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP4-16G5E9R7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP4-16G5E9R7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP4-16G5E9R7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP4-16G5E9R7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP4-16G5E9R7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP4-16G5E9R7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRTAP4-16G5E9R7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP4-16G5E9R7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP4-16G5E9R7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KRTAP4-16G5E9R7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KRTAP4-16G5E9R7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP4-16G5E9R7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP4-16G5E9R7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP4-16G5E9R7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP4-16G5E9R7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP4-16G5E9R7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KRTAP4-16G5E9R7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KRTAP4-16G5E9R7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KRTAP4-16G5E9R7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP4-16G5E9R7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRTAP4-16G5E9R7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP4-16G5E9R7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP4-16G5E9R7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP4-16G5E9R7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KRTAP4-16G5E9R7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRTAP4-16G5E9R7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRTAP4-16G5E9R7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRTAP4-16G5E9R7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRTAP4-16G5E9R7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRTAP4-16G5E9R7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP4-16G5E9R7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP4-16G5E9R7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP4-16G5E9R7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP4-16G5E9R7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP4-16G5E9R7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRTAP4-16G5E9R7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRTAP4-16G5E9R7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP4-16G5E9R7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP4-16G5E9R7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP4-16G5E9R7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP4-16G5E9R7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP4-16G5E9R7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRTAP4-16G5E9R7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRTAP4-16G5E9R7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRTAP4-16G5E9R7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP4-16G5E9R7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP4-16G5E9R7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP4-16G5E9R7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP4-16G5E9R7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP4-16G5E9R7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP4-16G5E9R7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRTAP4-16G5E9R7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRTAP4-16G5E9R7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP4-16G5E9R7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP4-16G5E9R7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP4-16G5E9R7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP4-16G5E9R7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP4-16G5E9R7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms