Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMED3Q9Y3Q3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMED3Q9Y3Q3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED3Q9Y3Q3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMED3Q9Y3Q3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms