Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P9

RABGAP1, Rab GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1Q9Y3P9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGAP1Q9Y3P9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RABGAP1Q9Y3P9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RABGAP1Q9Y3P9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGAP1Q9Y3P9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGAP1Q9Y3P9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms