Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTP11Q9Y3A2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UTP11Q9Y3A2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UTP11Q9Y3A2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTP11Q9Y3A2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTP11Q9Y3A2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms