Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FARSAQ9Y285 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FARSAQ9Y285 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FARSAQ9Y285 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FARSAQ9Y285 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms