Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRPC6Q9Y210 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPC6Q9Y210 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRPC6Q9Y210 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRPC6Q9Y210 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPC6Q9Y210 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms