Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
TTF2Q9UNY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TTF2Q9UNY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF2Q9UNY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TTF2Q9UNY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF2Q9UNY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms