Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA11Q9UKX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA11Q9UKX5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGA11Q9UKX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA11Q9UKX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA11Q9UKX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms