Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TNIKQ9UKE5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
TNIKQ9UKE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
TNIKQ9UKE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TNIKQ9UKE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TNIKQ9UKE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TNIKQ9UKE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 662.7 ms