Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD1Q9UIS9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MBD1Q9UIS9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD1Q9UIS9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD1Q9UIS9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms