Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3KQ9UBQ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3KQ9UBQ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3KQ9UBQ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3KQ9UBQ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms