Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT1Q9P2V4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT1Q9P2V4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRIT1Q9P2V4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIT1Q9P2V4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT1Q9P2V4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT1Q9P2V4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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