Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTR3BQ9P1U1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR3BQ9P1U1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3BQ9P1U1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTR3BQ9P1U1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3BQ9P1U1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms