Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCTD5Q9NXV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCTD5Q9NXV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCTD5Q9NXV2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCTD5Q9NXV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCTD5Q9NXV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD5Q9NXV2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
KCTD5Q9NXV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD5Q9NXV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms