Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATP8A2Q9NTI2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ATP8A2Q9NTI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ATP8A2Q9NTI2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP8A2Q9NTI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP8A2Q9NTI2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATP8A2Q9NTI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms