Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4CQ9C0C4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4CQ9C0C4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4CQ9C0C4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms