Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INO80BQ9C086 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INO80BQ9C086 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INO80BQ9C086 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INO80BQ9C086 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80BQ9C086 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms