Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC3Q9BY71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC3Q9BY71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC3Q9BY71 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC3Q9BY71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC3Q9BY71 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms