Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLVAPQ9BX97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLVAPQ9BX97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLVAPQ9BX97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PLVAPQ9BX97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLVAPQ9BX97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms