Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED9Q9BVK6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED9Q9BVK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED9Q9BVK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED9Q9BVK6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms