Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOL4Q9BPW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOL4Q9BPW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOL4Q9BPW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOL4Q9BPW4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1821 ms