Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACAP3Q96P50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACAP3Q96P50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ACAP3Q96P50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms