Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGD4Q96M96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FGD4Q96M96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FGD4Q96M96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD4Q96M96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FGD4Q96M96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD4Q96M96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms