Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD3Q96L08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUSD3Q96L08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SUSD3Q96L08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUSD3Q96L08 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUSD3Q96L08 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD3Q96L08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD3Q96L08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD3Q96L08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms