Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SUSD3Q96L08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SUSD3Q96L08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SUSD3Q96L08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SUSD3Q96L08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SUSD3Q96L08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SUSD3Q96L08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SUSD3Q96L08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SUSD3Q96L08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SUSD3Q96L08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SUSD3Q96L08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SUSD3Q96L08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SUSD3Q96L08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SUSD3Q96L08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SUSD3Q96L08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SUSD3Q96L08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SUSD3Q96L08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SUSD3Q96L08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUSD3Q96L08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUSD3Q96L08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUSD3Q96L08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUSD3Q96L08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUSD3Q96L08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUSD3Q96L08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUSD3Q96L08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUSD3Q96L08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUSD3Q96L08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUSD3Q96L08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SUSD3Q96L08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SUSD3Q96L08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SUSD3Q96L08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SUSD3Q96L08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SUSD3Q96L08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUSD3Q96L08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SUSD3Q96L08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SUSD3Q96L08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SUSD3Q96L08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SUSD3Q96L08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SUSD3Q96L08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SUSD3Q96L08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SUSD3Q96L08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SUSD3Q96L08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SUSD3Q96L08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SUSD3Q96L08 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SUSD3Q96L08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SUSD3Q96L08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SUSD3Q96L08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SUSD3Q96L08 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SUSD3Q96L08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SUSD3Q96L08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SUSD3Q96L08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SUSD3Q96L08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SUSD3Q96L08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SUSD3Q96L08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SUSD3Q96L08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SUSD3Q96L08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SUSD3Q96L08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SUSD3Q96L08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SUSD3Q96L08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SUSD3Q96L08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SUSD3Q96L08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SUSD3Q96L08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SUSD3Q96L08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SUSD3Q96L08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SUSD3Q96L08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SUSD3Q96L08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SUSD3Q96L08 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SUSD3Q96L08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SUSD3Q96L08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SUSD3Q96L08 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SUSD3Q96L08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SUSD3Q96L08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SUSD3Q96L08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SUSD3Q96L08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SUSD3Q96L08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SUSD3Q96L08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SUSD3Q96L08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SUSD3Q96L08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SUSD3Q96L08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SUSD3Q96L08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SUSD3Q96L08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SUSD3Q96L08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SUSD3Q96L08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SUSD3Q96L08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SUSD3Q96L08 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SUSD3Q96L08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SUSD3Q96L08 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SUSD3Q96L08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SUSD3Q96L08 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SUSD3Q96L08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SUSD3Q96L08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SUSD3Q96L08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SUSD3Q96L08 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SUSD3Q96L08 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms