Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
COG3Q96JB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
COG3Q96JB2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COG3Q96JB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COG3Q96JB2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
COG3Q96JB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
COG3Q96JB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COG3Q96JB2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COG3Q96JB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms