Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3DQ96BQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3DQ96BQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3DQ96BQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM3DQ96BQ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms