Protein–RNA interactions for Protein: Q96AD5

PNPLA2, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA2Q96AD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA2Q96AD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNPLA2Q96AD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA2Q96AD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA2Q96AD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PNPLA2Q96AD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA2Q96AD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA2Q96AD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA2Q96AD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA2Q96AD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms