Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXJ1Q92949 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXJ1Q92949 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXJ1Q92949 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXJ1Q92949 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXJ1Q92949 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms